防疫科：负责全市传染病信息、聚集性疫情及突发公共卫生事件监测、报告管理和质量评价；完成省下达的急性重点传染病防控工作指令性任务；制订和实施全市传染病防控工作计划、方案；负责全市传染病突发公共卫生事件调查处置指导；开展传染病疫情定期分析和专题分析，提出防控建议。
• 寄生虫病和地方病防制科
• 病原微生物检验科
• 职业卫生与放射卫生科
• 血吸虫病预防控制所
• 学校卫生科
• 卫生检验所
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